工厂化循环水从水处理的侧重点不同分为机械模式和生化模式，主要区别就是看能耗大小，本文所讲的是生化模式。这个模式能否成功，与虹吸能否顺利运行有直接关系，虹吸设备需要时常维护否则会莫名其妙的失效。有人说：我都准备投入了30万，你告我天天还得维护，这是搞毛线啊？虹吸失败的话，整个系统视养殖密度在两天到四天以内崩溃----鱼虾死光光。工厂化循环水系统的重点是净水系统，占比50%；生物习性占30%；其他的溶氧恒温等条件的占比20%。
构建的工厂化循环水养鱼系统，主要通过优化集成一批节本、节能型养殖设施及水处理技术，包括单元式养殖池、生物移动床、截留沉淀、气提泵等，在保证系统水处理效果及生产能力的同时，有效降低了系统运行能耗。以同等养殖密度为40kg-50kg/m3，每日换水量为5%-10%/天计算，系统整体运行能耗相对于常规典型的循环水养殖系统可降低30%左右，比较符合我国可持续发展与健康养殖要求的，是一种具有良好推广应用前景的工厂化循环水养殖模式。
对于所有养殖石斑鱼的养殖户来说，能够一下解决以上所有问题的方法就是采用室内循环水养殖设备养殖石斑鱼，室内循环水养殖也称工厂化循环水养殖，能够很好的避免低温对养殖石斑鱼的影响。循环水养殖设备能够*大化改善养殖水的水质问题，避免水体环境的恶化，降低有害病菌的滋生，保证石斑鱼健康成长。