工厂化循环水养殖系统的典型工艺和装备是以物理过滤结合生物过滤为主体，对养殖水体进行深度净化，并集成了水质自动监控系统，实时监测并调控养殖水体质量并可追溯。该系统具有工艺技术完善、水处理效果好、水质状况稳定、生产操作舒适、设备维护简便、运行成本低、系统投资省等优点。这是一套简洁有效的工艺技术路线：鱼池出水自流进入微滤机池，去除残饵和鱼粪等颗粒直径大于60微米的固体悬浮物质，经水泵提升进入生物滤器，一方面截流微小的颗粒悬浮物，另一方面对水体中的氨氮进行降解，净化后的水自流回鱼池。
当滚筒内悬浮物积聚到一定数量时，会引起滤网透水量下降，导致滚筒内水位上升，当水位上升到设定的高水位时：液位自动控制系统工作，此时，反清洗水泵和滚筒电机同时自动开启，反清洗水泵的高压水经微滤机的反清洗系统对旋转的滚筒滤网进行高压清洗，堵塞在滚筒滤网上的悬浮物在高压水的冲洗下，流入污物收集槽再经排污管排出。做工厂化循环水养殖，选择好循环水养殖水处理系统关键。依靠专业的技术能力，在节约系统占地面积的同时，率先做到了低能耗，整个循环水养殖水处理系统只在水泵和消毒设备上使用到电能，其余均实现了水力自动化，相比较目前市场上的水处理系统，在能耗上大幅降低，成为了养殖用户的重要选择。
广州环控农业生物科技有限公司针对如何防止水产养殖疾病的滋生做出了长时间研究，经过几年时间的不断反复研究，发现病毒的滋生主要是因为养殖水体质量变差恶化造成的，很多的病毒在养殖水体质量差的环境中会显得异常活跃。同时广州环控经过几年时间的研究发现，水产养殖户们所做的防护措施根本是治标不治本的，可能短时间内有效，因为他们根本没有一整套完整的系统去维持水体环境质量。