结合工厂化循环水养殖系统的特点，研究开发出节能环保，占地面积少，土地使用效率高，能有效隔离病害和控制病源的侵入，降低鱼苗的携菌和发病率的封闭式工厂化养殖循环水处理系统：在台风自然灾害较多的南方，工厂化循环水养殖可有效抵御自然灾害对水产养殖业毁灭性的打击。在循环水养殖系统中，重要的就是水质的净化处理，这关乎到水产养殖的成败。目前，传统的循环水养殖系统由于大量电力化设备的使用，能耗特别高，加之部分设备耐腐蚀性差，成为现在做循环水养殖头疼的事情。
工厂化循环水养殖系统中溶解氧是非常重要的，溶解氧是养殖动物氧气需求的来源，是养殖动物生存及正常生理活动的根本保证。溶解氧可以氧化残留有机质跟水体及池底的有害物质，有利于耗氧性微生物生长繁殖，促进有机物降解，减少有毒、有害物质的作用，抑制厌氧微生物的活动。总而言之，溶解氧对于水产养殖，是一个重要的因素之一。在养殖中，偶尔会存在溶解氧不足的情况，溶氧不够无法提高产量甚至会影响水质，这时我们就必须为养殖水里增氧。增氧的方式有很多种，常见的有罗茨风机、高压风机、液氧罐、制氧机等等。
目前我国平均每立方米的产量为7.4 公斤（淡水为8.2公斤、海水为6.4公斤），全国范围循环水养殖发展力不足的特征仍较明显。目前工厂化养殖的方式大体上分为流水养殖、半封闭循环水养殖和全封闭循环水养殖等三种形式。受水处理成本的压力，仍主要以流水养殖、半封闭循环水养殖为主，真正意义上的全工厂化循环水养殖工厂比例极少。我国工厂化循环水养殖发展中存在的问题，主要还是受限于经济实力、产品市场、养殖品种、养殖规模、经济效益比等因素，主观上还受限于养殖者对养殖技术的掌握和对先进技术的利用。